碳源是指向大氣中釋放碳的過程、活動或機制。自然界中碳源主要是海洋、土壤、巖石與生物體，另外工業生產、生活等都會產生二氧化碳等溫室氣體，也是主要的碳排放源。

碳源在污水處理廠的使用主要分為提供微生物合成菌體繁殖的主要營養、反硝化的電子供體、生物除磷協助聚磷菌釋放。也可以說碳源就是污水廠維持微生物生長最主要的原料之一。