濕化器可能通過兩種獨特的機制影響霧化治療。首先，如果使用一個熱濕氣交換過濾器，預期這樣的過濾器是幾乎不可滲透的氣溶膠顆粒。因此，呼吸機霧化器置于吸氣端的上游時，在霧化過程中需要移除一個熱量和水分交換過濾器。

　　如果使用加熱的加濕器，由于水從氣體向微粒的擴散（吸濕微粒的增長），會導致氣溶膠微粒的大小增加。這將促進氣溶膠在呼吸機循環的慣性沖擊，從而減少有效遞送。然而，霧化期間關掉濕化器是否有效是可疑的，因為濕化系統不可能很快降溫，不能明顯減少氣溶膠濕化，而且暴露在無濕化的風險中。一種麻煩但有效的辦法是：只在呼吸機霧化器的霧化過程中使用一個單獨的干燥回路，并在給藥后換成濕化回路。

　　對機械通氣患者應用呼吸機霧化器吸入抗生素時，建立標準的操作流程。這些流程需要有清單組成，包括適應癥、實施步驟及病人監測。